截至5月28日晚，各督查組已對212個地級市報送的1098個水源地3299個問題清單開展了現場核查，并通過12369電話、微信舉報以及衛星遙感監測結果提供的線索，新發現42個問題，主要包括工業企業、農業面源污染、生活面源污染等。

  河北省7個問題(涉及石家莊市、邯鄲市、滄州市)，安徽省6個問題(涉及合肥市及廬江縣、六安市霍山縣、蚌埠市懷遠縣)，浙江省4個問題(涉及衢州市龍游縣、紹興市諸暨市)，山西省3個問題(涉及太原市、臨汾市)，內蒙古自治區3個問題(涉及赤峰市)，云南省3個問題(涉及昆明市、楚雄州雙柏縣、曲靖市師宗縣)，遼寧省2個問題(涉及鐵嶺市)，湖南省2個問題(涉及岳陽市湘陰縣、邵陽市洞口縣)，廣東省2個問題(涉及深圳市)，廣西壯族自治區2個問題(涉及玉林市、賀州市)，四川省2個問題(涉及廣安市華鎣市)，貴州省2個問題(涉及畢節市黔西縣、黔東南州從江縣)，陜西省2個問題(涉及榆林市)，江西省1個問題(涉及南昌市)，河南省1個問題(涉及商丘市)。

  此次督查發現，安徽省合肥市、云南省昆明市、江西省南昌市3個地級城市水源地排查整治不徹底，未按生態環境部要求于2017年年底前全面完成地級水源地排查整治工作。